problemas com MANOVA

[Luis Eduardo]

Olá,
preciso de ajuda com relação aos meus dados, já procurei bastante pela internet e em livros mas não acho o que procuro.
Sou biólogo e estou analisando a forma de uma espécie animal. O output do programa é uma análise de componente principal, por isso tenho apenas os componentes principais para analisar. Com os componentes mais informativos (8), fiz uma análise de variância para testar se indivíduos de duas localidades são iguais, e a diferença foi estatisticamente significante. Fiquei preocupado se isso não pode ser um artefato dos meus dados pela diferença da amostra (56 indivíduos de uma localidade e 121 da outra), mas acredito que a ANOVA não seja tão sensível.
Quando testei a homocedascidade (é assim que se escreve?) pelo teste de Levene, apenas o PC1 (o mais importante, que explica 40% da variancia) foi significante (p<0,00001), o resto nem passou perto. Por isso não sei se preciso fazer um teste não-paramétrico (Kruskal-Wallis) ou se minha análise é robusta.
Obrigado,
Luís